西漢建元四年（前137）設龍亢縣，屬沛郡；東漢時屬沛國，西晉時屬譙國淮南郡；東晉時龍亢縣南遷至歷陽（今和縣），北魏及唐初在原地安置龍亢縣，唐武德六年（623），僑置于和縣的龍亢縣廢，保留渦河流域原地的龍亢縣。
南宋時，宋室南遷，龍亢縣廢；元、明、清屬懷遠縣；是懷遠縣西部的重鎮，清乾隆二十一年（1756），清政府在龍亢設二衙。
1950年設龍亢區；1992年撤區并鄉，全區7個鄉合并為3個鄉、鎮；2004年撤鄉并鎮將項橋鄉納入龍亢鎮至今。