泊崗鄉地域歷史上屬盱眙縣管轄，據《盱眙縣志》記載；明朝時泊崗地區屬盱眙縣淮陵鄉，清朝沿襲明制；1932年將盱眙、滁縣、來安、定遠設置嘉山縣，成立泊崗鄉，隸屬于嘉山縣管理；1940年2月嘉山縣抗日民主政府成立，泊崗鄉隸屬于嘉山縣抗日民主政府管轄。
1940年9月劃歸盱鳳嘉縣抗日民主政府；1946年9月劃歸盱鳳嘉縣委縣政府北撤，泊崗鄉劃歸泗南縣。
1947年7月恢復盱鳳嘉縣，泊崗鄉劃回；1947年1月17日盱鳳嘉縣全境解放；1949年5月盱鳳嘉縣建置取消，泊崗鄉劃入五河縣；同年10月又從五河縣劃歸嘉山縣管轄；1958年政社合一，泊崗鄉更名泊崗人民公社，隸屬嘉山縣管轄；1983年泊崗人民公社復稱泊崗鄉，隸屬嘉山縣人民政府管轄；1994年5月嘉山縣撤銷改設明光市，泊崗鄉隸屬于明光市人民政府管轄。