彌陀清代隸屬于永福鄉、長寧鄉。
民國初設彌陀寺鎮。
1949年-1951年，屬南陽區。
1952年，成立彌陀區政府，區址位于彌陀寺，轄安樂鄉、田家鄉、彌陀鄉等13個鄉。
1958年，屬花涼亭公社。
1959年恢復區建制，增設安樂公社。
1960年，改為彌陀人民公社，轄九田、河口、彌陀、安樂、田家五個鄉。
1961年恢復彌陀區。
1969年，彌陀區、彌陀公社改為向陽區、向陽公社。
1978年，恢復彌陀區、彌陀公社。
1984年體制改革，更名為彌陀鄉。
1992年，彌陀、安樂、田家3個鄉合并設立彌陀鎮。
2004年，河口鄉并入彌陀鎮。
2005年村級調整，現下轄10個行政村和1個居委會。