西周為燕國的都城所在地。
戰國為燕國中都屬地。
明代，為燕谷里。
清代，為琉璃河鎮。
民國五年（1916年），琉璃河鎮屬良鄉縣第六南一區。
民國十七年（1928年），琉璃河鎮屬良鄉縣三區。
1949年，琉璃河鎮屬良鄉縣七區。
1951年，琉璃河鎮屬良鄉縣三區。
1956年，琉璃河鎮屬良鄉縣。
1958年，琉璃河鎮屬周口店區琉璃河人民公社。
1960年，琉璃河鎮屬房山縣琉璃河人民公社。
1966年，設琉璃河鎮。
1968年，并入琉璃河人民公社。
1980年，恢復琉璃河鎮。
1983年，琉璃河公社改鄉。
1989年，琉璃河撤鄉設琉璃河地區辦事處。
2000年，在琉璃河地區辦事處設琉璃河鎮（兩塊牌子，一套人馬）。
2002年，合鄉并鎮，東南召鎮與窯上鄉并入琉璃河鎮。