宋、元、明、清時期，均屬酉陽土司管轄區。
清雍正十三年（1735年），“改土歸流”后，屬酉陽縣上下里。
民國十七年（1928年），為北五鄉，屬酉陽縣第三區。
1952年3月，北五鄉劃入黔江縣第七區，分設馬喇鄉、早化鄉、官莊鄉。
1953年3月，由馬喇鄉析置印合鄉。
1956年4月，官莊、印合鄉劃入馬喇鄉。
1958年5月，改建馬喇公社。
1961年2月，馬喇公社析置官莊公社。
1984年2月，撤馬喇公社更名為馬喇鄉。
1988年8月，撤馬喇鄉改設馬喇鎮。
2001年11月，小莊鄉并入馬喇鎮。