據上輩老人口述:頂坑村在明末崇禎期間,因戰亂引發社會動蕩而從漳浦縣移居于此;1949年解放后屬莆田縣第八區管轄(稱黨坑鄉),1949年解放后屬8區渡里鄉,1952年屬15區,1954年屬14區,1955年屬黨城鄉,1957年屬黨渡鄉頂坑村,1958年屬常太公社頂坑大隊,1961年屬渡山公社頂坑大隊,1965年屬常太公社頂坑大隊,1984年12月改為常太鄉頂坑村委會。
1992年月10月屬莆田縣常太鎮。
2002年為莆田市城廂區常太鎮頂坑村委會。