自古以來，日溪就是中原通向福州的“入省通道”和“通津要口”，古時日溪被稱為“密溪”，后因福州方言中“密溪”與“溺溪”發音相同，不吉，后改為“日溪”。
目前尚有兩條古驛道保存完好。
明、清屬侯官縣五十七都管轄，民國設閩侯縣第八區日溪鄉日溪村，1949年12月劃歸閩侯縣第八區（即石牌區）日溪鄉日溪村，1961年12月歸福州郊區設日溪公社，日溪大隊，1971年3月成立北峰區，設日溪公社、日溪大隊，1984年日溪鄉日溪村委會至今。