明代前形成村落，有張家大莊、五個大門、王家老莊、王家下莊等。
明、清時為永昌衛（縣）寧遠堡東灣。
民國時屬永昌縣寧遠鄉（區）七保。
1949解放初為永昌縣第四（寧遠）區四鄉。
1952年屬永昌縣第五（寧遠）區第九（東灣）鄉。
1956年1月撤區并鄉后屬永昌縣寧遠堡鄉。
合作化時組建七個初級農業合作社。
1956年并為升光高級農業合作社，1958年9月鄉改為人民公社，高級農業合作社改為生產大隊。
是年11月，并入金川公社，為該公社寧遠大隊東灣生產隊。
1961年撤銷金川公社建寧遠堡公社為寧遠堡公社東灣大隊。
1968年改名為紅星公社東方紅大隊，1970年恢復原名。
1975年因居住密集，不適應居民需求，將部分生產隊各自定點整體遷居。
1981年劃入金昌市隸屬寧遠堡公社。
1983年政社分設改為寧遠堡鄉東灣村村民委員會，村委會駐地東灣，轄13個村民小組。
1984年歸金川區寧遠堡鄉。
1999年12月撤鄉建鎮，改為寧遠堡鎮東灣村沿用至今。
從2010年起，將中牌、西灣、東灣三村集中在寧遠堡關爺廟灘（北大灘），統一規劃，以村為片，建設城鎮化新農村，至2014年末，大部分村民已遷入新居，仍有部分村民尚未遷入新村，處于新農村與舊居并存狀態。
2007年3月設立東灣村社區工作委員會。
2013年設立村務監督委員會。
村民委員會、村社區工作委員會、村務監督委員會一套人馬三塊牌子合署。