民國初期，沿襲清制，武威縣的行政管理區按水系劃分為六個渠，即黃渠（黃羊河水系）、大渠（雜木河上游）、雜渠（雜木河下游）、金渠（金塔河水系）、懷渠（西營河上游）、永渠（西營河下游）。
民國24年（1935），將六個行政管理區劃分為2個鎮、12個鄉，屬大河鄉第二保。
中華人民共和國成立初屬大河區長城鄉。
1956年撤區并鄉屬長城鄉長城高級社，1958年人民公社化時屬清源公社長城大隊。
1962年區劃調整時成立長城公社，命名為五墩大隊。
1983年撤社改鄉時設立五墩村民委員會，隸屬長城鄉所轄。
2017年1月，撤銷長城鄉設立長城鎮，屬長城鎮所轄。