西漢至十六國“五涼”時期，韓佐鎮境域分屬武威郡鸞鳥縣和姑臧縣。
北魏至隋初，屬武威郡林中縣。
唐宋年間，復歸姑臧縣。
元時，屬永昌路西涼州。
明清時期，先后歸涼州衛和武威縣。
民國元年（1912年）后，分屬武威縣古城、大河鄉。
1949年9月后，屬古城、大河區。
1952年7月，屬第九區（古城）、第十區（大河）。
1956年1月，為古城鄉。
1958年10月，成立古城公社。
1962年，成立韓佐紜�1983年7月，設韓佐鄉。
1986年1月，韓佐鄉并入古城鄉。
1991年11月，析設韓佐鄉。
2018年3月，撤鄉，設韓佐鎮。