西漢元鼎二年（公元前115年），析上都增置清水縣，戎邑道，戎邑道治所就在今黃門鄉。
北宋太平興國四年（979年），置冶坊寨（今黃門鄉王店村）。
南宋建炎三年（1129年），金升冶坊寨為縣（今黃門鄉王店村）；嘉定八年（1215年），冶坊縣隸屬鳳翔府秦州；咸淳六年（1270年），廢冶坊縣并入清水縣。
民國元年（1912年）后，屬上郵鎮。
1950年，屬上擲區黃門鄉。
1952年，設黃門區黃門鄉。
1958年，為黃門公社。
1983年，公社改鄉。
2015年11月，撤鄉設鎮，鎮政府駐地及行政區域管轄范圍不變。