1949年屬潘嶺鄉的一個自然村，歸清福區管轄；1958年8月由鄉人民委員會直接領導農業生產合作社，雷神廟社屬潘嶺鄉管轄；1958年9月，潘嶺鄉15社并為衛星公社，1958年12月撤銷先鋒、衛星兩個人民公社，衛星公社并入平涼市大寨人民公社；1961年6月調整人民公社規模，成立潘嶺人民公社，從大寨人民公社分出，1964年6月撤銷潘嶺公社并入大寨人民公社，設雷神廟大隊，1983年7月人民公社改鄉，雷神廟生產大隊改為雷神廟村民委員會。