民國十八年（1929年），屬玉門縣第區。
民國三十二年（1943年），屬靖邊鄉。
民國三十八年（1949年），設靖邊區，轄10鄉。
1953年，將靖邊區分設靖西、靖東2區，靖西區轄川北鎮、南陽鎮、芨芨臺子、黃閘灣、西黃花營、東黃花營6鄉。
1955年，撤區并鄉，設南陽鎮、黃閘灣（包括西黃花營）黃花營3鄉。
1958年，成立衛星公社，后屬玉門鎮公社靖西管理區。
1961年5月，設立黃閘灣公社增設北湖村。
1983年3月，改為黃閘灣鄉。
2016年1月，根據《甘肅省民政廳關于酒泉市肅州區泉湖鄉等8個鄉鎮撤鄉改鎮的批復》（甘民復〔2015〕50號），黃閘灣鄉撤鄉改鎮，改為黃閘灣鎮。
2016年5月，正式撤鄉改鎮掛牌。