明萬歷年間（1573～1620）黃、鄭、鐘、張諸姓到此定居，后來朱姓從惠來鳳紅、嚴姓從汕頭市達濠東湖，許姓從澄海橫隴、陳姓從普寧橋柱到此聚居。
1958年建頂溪水庫，1959年移民建新村于葵和公路與仙靖公路交叉處的東面，至今仍用原村名。
1958年后頂溪村合并新鄉村、仙庵村為一個大隊，稱仙庵大隊；1971年從仙庵大隊拆出成立頂溪大隊；1983年區鄉制改革，改稱鄉政府；1987年改為管理區；1999年改設村委會至今。