民國二十二年（1933）設覃塘區，屬貴縣。
1950年為貴縣第三區。
1955年復稱覃塘區。
1958年改公社。
1984年改鎮。
1988年屬貴港市(縣級)。
1996年設立覃塘管理區。
2003年3月析置覃塘區，轄覃塘、東龍、三里、黃練、石卡、五里6鎮和古樟、振南、山北、蒙公、大嶺5鄉，屬貴港市。
2004年11月，振南、古樟2鄉合并為樟木鄉。
截至2022年，覃塘區下轄1個街道，7個鎮，2個鄉，分別是覃塘街道，東龍鎮，三里鎮，黃練鎮，石卡鎮，五里鎮，樟木鎮，蒙公鎮，山北鄉，大嶺鄉。