1933年為軍屯、古高、禮村3村，屬永安鄉。
1950年古高、禮村2村并入雄獅村，屬古底區，后屬百壽縣第三區。
1952年軍屯村與雄獅村部分轄域（古高、禮村等自然村）合設軍屯鄉，屬永福縣第八區。
1955年屬古底區。
1956年屬和平區。
1958年改軍屯大隊，屬和平公社。
1962年改軍屯公社，屬和平區。
1968年復改軍屯大隊，屬和平公社。
1982年屬永安公社。
1984年改軍屯村，并設立軍屯村民委員會。
1987年改軍屯村公所，屬永安鄉。
1995年復設軍屯村民委員會，屬永安鄉。
1997年村委會由軍屯搬遷至石墻。