民國時期，實行新憲制，改區、聯保為鄉（鎮），隸屬秧壩鄉；1958年，建立秧壩生產大隊，成立秧壩生產大隊管理委員會，隸屬秧壩區秧壩公社；1984年，冊亨縣行政區劃變動，秧壩生產大隊管理委員會更名為秧壩村民委員會，隸屬秧壩鄉；1991年，實行建鎮并鄉撤區，秧壩鄉更名為秧壩鎮，秧壩村委會隸屬秧壩鎮；1998年，秧壩村委會隸屬秧壩鎮；2007年，實行村級整合，秧壩村委會隸屬秧壩鎮；2016年，實行鄉鎮區劃調整，秧壩村委會隸屬秧壩鎮。