明崇禎三年（1630年），流長鄉屬息烽守御千戶所轄地。
清順治十五年（1658年），屬敷明衛息烽千戶所。
清康熙二十六年（1687年），改園修文縣仁和里。
民國三年（1914年），息烽建縣屬貴州黔中道，設東、南，西，北、中5區，區下設里，里下設甲，流長屬北區。
民國十五年（1926年）秋，訂各區名稱，北區為六區，駐地流長。
轄4保。
民國二十年（1931年）秋，保改鄉鎮，六區轄流長鎮、茶園鄉、甘溪鄉、草壩鄉、翁伸鄉、水尾鄉等鄉鎮。
民國二十四年（1935年），撤鄉建聯保。
民國三十年（1941年）10月，實行新縣制，撤區及聯保，改編鄉鎮，流長鄉為全縣10鄉鎮之一，鄉公所駐流長。
1949年11月17日，息烽縣解放。
1950年1月7日，建九莊區，又稱三區，流長鄉屬九莊區。
1951年2月，設黑神廟區，稱四區，流長鄉劉歸黑神廟區。
7保改7行政村。
1952年4月，7行政村合并為5個。
1953年，行政村改鄉鎮，為流長、龍井，茶園，甘溪、新場5鄉，屬黑神廟區。
1957年4月，茶園，龍井鄉并入流長鄉。
1958年9月，全縣鄉鎮合并建公社，實行政社合一，新場鄉并入流長公社，下轄流長、新場兩個管理區，仍屬黑神廟區。
同年12月，實行一區一社，黑神廟區改稱紅旗公社，流長，新場為管理區。
1961年3月，全縣恢復區公所建制，又劃分為流長和新場公社。
1963年3月，全縣將16公社分建為32個。
1965年7月，全縣32公社合建為25個，流長，新場仍為公社屬黑沖廟區。
1982年9月，新場公杜更名土城壩公社。
1984年3~4月，撤銷公社，恢復鄉建制。
1987年8月，土城壩鄉復為新場鄉。
1992年，全縣撤區并鄉建鎮，原王家坪鄉甘溪，龍塘2村以及新場鄉全部劃歸流長鄉。
2016年4月22日，撤銷流長鄉，設置流長鎮。