民國時，屬圍場縣第二區。
民國三十四年（1945年）8月，屬圍場縣腰站區。
民國三十五年（1946年）10月，為邊墻山鄉。
民國三十六年（1947年）1月，劃歸圍北縣；同年5月，屬腰站區；同年7月，腰站區撤銷，改屬銀窩溝區；同年11月，圍北縣撤銷，復歸圍場縣。
民國三十七年（1948年）9月，建腰站區，屬之。
1949年9月，并入四合永區。
1950年3月，屬第一區。
1958年9月，屬東風公社。
1961年8月，析邊墻山、碑亭子、烏拉溝、腰站、大榆木溝、下三合義、上三合義7個大隊建腰站公社。
1974年4月，銀鎮公社的永合棧、永北兩個大隊和蘭旗卡倫公社的畫山、六合店兩個大隊并入。
1983年12月，撤銷公社，改建腰站鄉。
1986年5月，改為腰站滿族鄉。
1989年6月，復為腰站鄉。
1996年1月，清泉鄉并入。
2013年，撤鄉設鎮。