建國前夕屬石花區。
1951年6月，屬石花區新店鄉。
1956年高級社時，取名愛國社，屬縣轄新店鄉。
1958年人民公社化時期更名為愛國大隊，隸屬幸福之家人民公社新店管理區管轄。
1961年恢復區制，屬石花區新店公社。
1975年撤區并社，屬石花公社新店管理區。
1981年更名為楊溪灣大隊，屬大峪橋公社新店管理區。
1984年“政社分設”時更名為楊溪灣村，隸屬大峪橋鎮管轄。
2001年大峪橋鎮被撤銷，其所轄行政管理區劃歸石花鎮。
2002年，余家店村合并入楊溪灣村，由石花鎮管轄至今。