唐虞三代，地屬揚州。
東周、春秋前期屬楚。
后屬吳。
漢文帝十六年（前164），境內始設立尋陽縣（縣治在如今黃梅縣蔡山鎮附近）。
西晉永興元年（304）劃廬江的尋陽，武昌的柴桑設尋陽郡。
又劃以（今）太白湖、龍感湖一線江北故道為界，北境屬蘄春縣轄，南境歸江南尋陽縣。
東晉太元三年（378），改蘄春縣為蘄陽縣。
南齊永明四年（486），劃蘄陽縣東境轄地設置永興縣。
隋開皇初（581），改永興縣為新蔡縣，隋開皇十八年（598）改新蔡縣為黃梅縣。
唐武德四年（621），將黃梅縣劃分為義豐、長吉、塘陽、新蔡四個縣，設南晉州轄。
唐武德八年（625）撤南晉州，又改為黃梅縣屬蘄州轄。
宋至道三年（997）分全國為十五路，屬淮南路蘄州蘄春郡轄。
元至元二十三年（1286），屬蘄州，隸屬湖廣行省。
皇慶元年（1312），遷縣治于今黃梅鎮，隸湖廣行中書省蘄州府。
明代改設司、府、州、縣制，屬湖廣布政司黃州府轄。
清沿明制，仍屬黃州府轄。
民國初，廢除黃州府，改屬江漢道轄。
后江漢道廢除，改屬湖北省第三行政督察區轄。
民國二十五年（1936），界定湖北、江西兩省省界時，國民政府行政院將長江以北九江縣屬封廓洲、團牌洲等地，劃歸湖北省黃梅縣轄。
民國二十九年（1940），改行政督察區為鄂東行省，黃梅隸之。
1949年屬黃岡地區轄。
1995年12月23日，《國務院關于同意湖北省撤銷黃岡地區設立地級黃岡市的批復》國函〔1995〕130號，撤銷黃岡地區和黃州市，設立地級黃岡市，黃梅縣隸屬黃岡市領導，沿用至今。