秦屬黔中郡、象郡地。
漢屬鐔成縣地，隸武陵郡。
唐貞觀八年（634年），析龍標縣地設朗溪縣，為會同縣境內置縣之始，隸巫州，后隸敘州。
五代時，縣廢，為誠州地。
宋崇寧元年（1102年）設三江縣，1103年改為會同縣，誠州改為靖州，會同縣屬靖州。
1914年，靖州廢，改屬辰沅道。
1922年，直屬湖南省。
1936年至1949年9月，先后屬湖南省第四、第七、第十行政督察區。
1949年10月設會同專區，同年11月1日成立縣人民政府，駐洪江市帶子街。
1950年3月20日，縣人民政府遷至林城鎮，轄7個區、1個縣屬鎮，下設117個鄉。
1950年12月，劃出洪江鎮，另立洪江市。
1951年7月，調整為8個區，轄117個鄉和1個鄉級鎮。
1952年8月，會同專區改為芷江專區，1952年12月，芷江專區改為黔陽專區。
1954年至1955年調整為8個區，轄117個鄉和1個城關鎮。
1956年6月并為27個大鄉和1個縣轄鎮，將沙溪區大橋鄉劃歸靖縣，靖縣六黃溪鄉劃入會同縣。
1958年9月，原28個鄉鎮合并，建立13個人民公社，并將大墓鄉劃歸靖縣。
次年12月，組成11個農村人民公社和1個城鎮人民公社；1961年7月，設25個農村人民公社，1個鎮人民公社；1962年6月，增設若水（轄8個公社）、朗江（轄5個公社）2區，1968年冬撤銷。
1981年6月，黔陽地區改為懷化地區。
1984年4月，公社改鄉，設25個鄉、1個鎮。
1985年4月，堡子鄉和坪村鄉改為堡子鎮和坪村鎮，設23個鄉、3個鎮。
1995年10月，團河、若水、朗江、廣坪4鄉改鎮，設19個鄉、7個鎮。
1997年10月，撤銷炮團、青朗、蒲穩、漠濱、寶田、金子巖6個鄉，建立炮團侗族苗族、青朗侗族苗族、蒲穩侗族苗族、漠濱侗族苗族、寶田侗族苗族、金子巖侗族苗族6個民族鄉，設13個鄉、6個民族鄉、7個鎮。
1997年11月，懷化地區改為懷化市，屬懷化市。
1999年12月，攀龍橋鄉并入林城鎮，設12個鄉、6個民族鄉、7個鎮。
2002年9月將馬鞍鄉改置馬鞍鎮，設11個鄉、6個民族鄉、8個鎮。