西漢元朔九年（前128年），夫夷侯國設都，名金城，為歷代縣治所在地。
明初，屬零陽、扶陽2鄉。
明萬歷三十二年（1604年），屬東、南2鄉。
清光緒十九年（1893年），城池擴至城郊石橋村，合稱“金石”。
民國十九年（1930年），屬第一、第二區。
民國二十四年（1935年），改為金石鎮。
1949年11月，廢保甲設區鄉，屬第一區。
1956年12月，撤區設辦事處，屬飛仙橋辦事處。
1958年9月，屬群力公社，同年12月，群力公社并入超美公社，并更名金峰公社。
1961年9月，析金峰公社置金石鎮（鄉級鎮），直屬新寧縣。
1984年5月，金石鎮升為區級鎮，金峰公社改鄉。
1985年2月，金峰鄉并入金石鎮。
1995年，撤區并鄉，水頭鄉并入金石鎮。
2015年，飛仙橋鄉、白沙鎮、金石鎮1鄉2鎮成建制合并設立金石鎮。