1949年3月,南通解放后,由團結村、公路村、河東村三個村組成。
1958年9月,南通市東方紅人民公社公路社(運河村)、中心社合并為南通市東方紅人民公社第六營。
成立第六營時共有中心社9個隊,公路社11個隊,合計20個隊。
公路社(運河村)11個隊,即現在的1-10組,另一個隊分散掉。
1961年5月,又由第六營分為兩個大隊。
即中心大隊和運河橋大隊。
運河橋大隊共10個隊,即現在的1-10組。
為了生產方便,4隊分出了一個隊,成了現在的運河13組。
1963年下半年,10隊分出了一個隊,即現在的運河11組。
1964年航運公司搬走后就給1、2、3組種植,后來建立了12組。
1979年開海港引河后,南通縣觀音公社8大隊3生產隊部分村民留在了海港引河河西,后劃歸了鐘秀鄉運河村,即現在的14組。
1987年運河橋大隊改為運河村,成立運河村村民委員會。
2007年11月,經崇川區政府批準撤銷運河村,建立運河社區居民委員會,名稱沿用至今。