1940年10月，屬阜寧縣抗日民主政權第一區(qū)。
1941年10月，改屬第二區(qū)。
1942年，夏屬吉溝區(qū)。
1943年初，復屬第二區(qū)。
1944年末，建立新溝區(qū)。
1946年7月，改屬第三區(qū)，年底改屬新第二區(qū)。
1947年8月，為新溝區(qū)。
1956年2月，并入陳集區(qū)。
1957年8月，設立新溝鄉(xiāng)。
1958年9月，與陳集鄉(xiāng)合并成立陳集先進公社，后改名新溝先進公社。
1959年4月，析出陳集公社。
1983年，復置新溝鄉(xiāng)。
1995年6月，撤銷新溝鄉(xiāng)設立新溝鎮(zhèn)。