清代屬順德鄉，民國初屬大同鄉，后屬第六區。
1941年后屬宿遷縣抗日民主政府塘湖區，后屬曉店區。
1949年為曉店區曉店鄉。
1957年撤區并鄉時，由曉店、光前、嶂山、仇圩、王溝等鄉合置曉店鄉。
1958年改置曉店人民公社。
1983年復置曉店鄉。
2000年塘湖鄉與曉店鄉合并，更名為曉店鎮。
2006年，原井頭鄉的王溝、新窯、陸莊、洋河灘四個村居并入曉店鎮，原塘湖鄉的馬樓、克先、許莊、九里、安圩以及三巨等村居并入宿豫區井頭鄉，曉店鎮整建制納入湖濱新城托管。
2007年8月，克先、苗莊等兩個村居納入曉店鎮管轄。
2009年4月，原屬皂河鎮的戴場村納入曉店鎮托管。
2010年4月，三巨村和馬窯居委會位于合歡路以北的13個居民小組納入曉店鎮托管。
2021年撤銷曉店鎮，設立曉店街道。