清道光二十三年（1843年），金州廳在長山列島設置島區（即金州16島）。
清光緒三十一年（1905年），日俄戰爭以后，淪為日本殖民地。
民國三十四年（1945年）11月，解放，建立鄉（區）人民政權，先后屬新金縣、金縣、長海（長山）縣。
1950年8月，獐子區為長山縣第四區。
1955年6月，第四區改稱獐子區。
1956年3月，獐子區改為獐子大耗、小耗、搭槌4鄉，直屬旅大市長海縣。
1958年6月，4鄉合并為獐子鄉。
同年10月，建獐子公社。
1983年9月，撤社建鄉，為獐子鄉。
1985年5月，撤鄉建鎮，隸屬未變。
2009年10月，獐子鎮改稱獐子島鎮。