宋建炎元年，高境鎮隸屬浙西路平江府昆山縣。
宋嘉定十年，昆山縣析出東部建嘉定縣，隸屬浙西路平江府嘉定縣。
元、明二代仍屬嘉定縣。
清雍正三年，嘉定縣析出東半境設寶山縣，隸屬江蘇省太滄州寶山縣依仁鄉。
宣統二年，屬江蘇省蘇松太道太倉州寶山縣江灣鄉。
1927年，劃歸上海特別市第二十二區。
1937年11月12日，上海淪陷于日寇，隸屬日偽“上海大道市政府第二十二區”。
1938年4月，隸屬日偽“督辦上海市政公署第二十二區”，10月隸屬日偽“上海特別市中心區”。
1945年8月，復歸上海市第二十二區。
1947年1月，隸屬上海市江灣區。
解放后，1950年屬上海市江灣區；1952年10月，江灣、新市二區合并為江灣區，隸屬江灣區；1956年上海市北郊區成立，隸屬北郊區。
1958年寶山縣劃歸上海市，屬寶山縣；1959年為江灣人民公社，1984年政社分開，改設為江灣鄉；1988年寶山縣與吳淞區合并為寶山區，隸屬上海市寶山區；1993年撤鄉建鎮，更名為高境鎮。
鎮域面積20.75平方公里。
1984年，鎮南、鎮北，紀念、奎照、勝利等5個村全部及高境、江楊、民主3個村部分土地分別劃人楊浦、虹口、閘北三區，生產管理和行政關系仍屬高境鎮。
1997年9月，寶山區人民政府撤消鎮6個村民委員會建制，使用至今。