原堡鎮鎮地處崇明島中部偏東南沿，西距縣城27千米。
民國十八年（1929年）置堡鎮鎮，民國三十四年（1945年）改為區，1949年6月復為鎮，該鎮分南北堡鎮；1950年10月經中央政務院批準，南北堡鎮合并，成立堡鎮鎮，為縣屬鎮；原堡鎮鄉位于縣境中部偏東南沿，堡鎮鎮從南向北橫穿堡鎮鄉中間，將其為東西兩部，故有東西兩半鄉之稱。
1957年10月由原地幾個小鄉合并成立堡鎮鄉；1958年10月成立堡鎮人民公社；1984年3月成立堡鎮鄉人民政府，轄18個村、3個專業場（即良種場、副業場、畜牧場）、1個苗圃、204個村民小組；1992年底下轄17個村委會。
原五滧鄉位于縣境東部南沿。
民國初年此地是箔沙鄉的一部分，抗戰時期分為四滧、五滧兩鄉，抗戰勝利后將原四滧鄉、五滧鄉合并為登瀛鄉；1950年3月分拆為東新鄉、新西鄉；1952年8月又分拆為五滧鄉、東新鄉、四滧鄉、新西鄉；1956年1月四鄉合并為五滧鄉、四滧鄉；1957年9月二鄉合并為五滧鄉；1958年9月成立五四人民公社，同年12月與合興人民公社合并成立五滧人民公社，翌年4月又同合興分開，仍稱五滧人民公社；1984年春成立五滧鄉人民政府。
1992年底下轄12個居委會、2個村委會。
1993年7月原堡鎮鄉與堡鎮鎮撤并成立新的堡鎮鎮；1994年11月新漁鄉堡鎮港漁民村劃歸堡鎮鎮；1995年7月五滧鄉四滧港漁民村劃歸堡鎮鎮；2000年12月由堡鎮鎮與五滧鄉撤并成立新的堡鎮。
名稱使用至今。