東平鎮前身是上海市東平地區社區管理委員會，在這之前又稱上海市長江地區社區管理委員會，由原上海市長江農場、前進農場2個社區組成，1959年冬至1964年間先后四次圍墾，分別建立東平農場、靜安區畜牧場、南市區畜牧場和市工業機關畜牧場；1959年12月縣圍墾東平沙后，建立東平農場；1960年10月上海市楊浦、閘北兩區相繼在此圍墾并建立畜牧場；1963年7月東平農場劃歸市農墾局，同年11月楊浦、閘北兩畜牧場合并成立上海市三沙洪農場；1963年底3個畜牧場合并為百萬沙農場；1963年10月兩場合并為上海市大新沙農場；實行經濟體制改革后，全場設農牧、工業、建筑和生活服務4個公司，下轄46個單位，其中農牧14個、工業21個。
1965年5月東平農場的一、二大隊及三大隊的部分生產隊并入百萬沙農場；1966年秋百萬沙農場改名為東方紅農場；1966年10月改名為前進農場。
1972年7月1日改為長江農場；長江農場：長江農場位于崇明島北沿中部。
1984年實行體制改革，撤銷4個農業管理區，興辦73個家庭農場。
該場原為東平沙，出漲于40年代末；1965年5月東平農場西部與三沙洪農場合并，仍稱上海市東平農場，翌年10月更名上海市東風農場。
前哨農場：前哨農場地處崇明島東端。
前身為東旺沙。
2001年4月經上海市農場管理局批準建立，也是該局系統內部最早進入政企分設的2個試點單位之一。
2002年12月25日上海市長江地區社區管理委員會經上海市農場管理局批準更名為上海市東平地區社區管理委員會。
2003年6月18日在上海市農場管理局對所屬農場（社區）歸并調整中，原上海市東風農場社區并入上海市東平地區社區管理委員會所轄區域管理。
2004年12月底原上海市前哨農場社區并入上海市東平地區社區管理委員會所轄區域管理。
至此上海市東平地區社區管理委員會就由原上海市東風農場、長江農場、前進農場、前哨農場4個社區組建而成。
前進農場：前進農場位于崇明島北沿中部。
東風農場：東風農場位于崇明島北沿西部。
2008年7月24日經光明食品集團和崇明縣委縣政府批準，組建東平社區政務移交小組，啟動在崇市屬國營農場政務移交并納入屬地化管理的前期運作。
2008年8月6日經上海市政府批準，建立崇明縣東平鎮，同年9月26日成立鎮政府籌建組，年前召開鎮第一次人民代表大會，選舉產生鎮政府領導班子。
2009年1月6日東平鎮黨委、人大、政府正式掛牌成立。
使用至今。