1961年設立南溝生產大隊；1984年撤銷南溝生產大隊，設立南溝村村民委員會。
1949年屬附城區的一個行政村，1950至1952年屬附城區現嶺行政村的一個自然村，1953至1955年屬三區南溝鄉的一個自然村，1956年屬附城基點偏橋底鄉的一個自然村，1957年屬附城基點積善鄉的一個自然村，1958至1960年為西河底紅旗公社南溝管理區，1961至1983年為西河底人民公社南溝生產大隊，1984至2000年為西河底鄉南溝村村民委員會，2001年撤鄉改鎮至今為西河底鎮南溝村村民委員會。