清代屬小水里；民國時期至1957年，屬第一區（駐城關）南王中編村管轄；1958年8月，中共中央作出《關于在農村建立人民公社問題的決議》，我國全面開展人民公社化運動，實行政社合一、撤鄉建社，農業生產合作社改稱為生產大隊；實行生產資料分別歸公社、生產大隊、生產隊三級組織所有的體制；1958年屬衛星（城關）人民公社水峪管理區；1961年為水峪人民公社水峪生產大隊；1983年10月，中共中央、國務院聯合發出《關于實行政社分開建立鄉政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉鎮，建立鄉（鎮）人民政府；同時，生產大隊改為村民委員會，撤銷生產大隊管理委員會。
靈石縣委、縣政府根據中共山西省委通知，在全縣進行基層政權體制改革，故將水峪人民公社改為水峪鄉，水峪生產大隊改為水峪村民委員會；2001年4月縣政府根據中辦發〔2000〕30號文件要求，經市政府、省政府批準，靈石縣部分鄉鎮區劃進行調整，將水峪鄉、南墕鄉、張家莊鎮整體合并到城關鎮，合并后更名為翠峰鎮，以原城關鎮、水峪鄉、南墕鄉、張家莊鎮的行政區劃為現翠峰鎮的行政區劃。
故水峪村民委員會至今屬翠峰鎮管轄。