明清時期屬西區九局。
民國時期屬四區。
1949年10月1日，中華人民共和國成立后，仍實行民國區村制。
全縣設6個區，71個行政村，馱澗成為行政村隸屬于第六區。
1952年，增設第七區（張馬），含馱澗行政村。
1953年5月劃鄉，改行政村為鄉建制，全縣6個區改為7個區，轄71個行政村，劃為65個鄉，成為馱澗鄉。
1955年撤區，馱澗鄉直屬縣，全縣劃為62個鄉。
1958年11月，鄉寧縣與吉縣合并，稱鄉吉縣。
1959年1月，增設寬井人民公社，轄馱澗鄉，3月鄉改成馱澗管理區。
1961年4月，鄉寧、吉縣分置，全縣共有16個人民公社，成為譚坪人民公社馱澗生產大隊。
1984年7月，實行政社分開，建立鄉（鎮），成為譚坪鄉馱澗村民委員會。
2001年3月，撤并鄉鎮，譚坪鄉、棗嶺鄉合并稱棗嶺鄉，成為棗嶺鄉馱澗村民委員會并沿用至今。