新中國成立前，屬夏縣第四區；1953年政區調整，屬夏縣四區郭王鄉；1956年夏縣廢區并鄉成立上王鄉，隸屬于上王鄉管轄；1958年，聞喜、夏縣分縣并入成立聞喜縣，垣峪村改稱垣峪生產大隊，屬聞喜縣水頭衛星人民公社上王管轄；1961年聞喜、夏縣分縣后成立上王人民公社，垣峪生產大隊隸屬于上王人民公社；1971年，上王公社劃入運城縣管轄，屬運城縣上王人民公社管轄；1984年5月，恢復鄉鎮建制，垣峪生產大隊更名為垣峪村民委員會，屬運城市（縣級市）上王鄉；2000年，撤地設市，屬運城市鹽湖區上王鄉管轄。