1951年，屬巴中縣義興鄉管轄。
1952年，屬九鎮鄉管轄。
1956年，屬三合鄉管轄。
1957年，屬九鎮鄉管轄。
1958年，設立包樹梁管理區。
1962年，更名為包樹梁生產大隊，簡稱包樹梁大隊，又稱二大隊。
1969年，更名為包樹梁大隊革命委員會。
1981年，復名包樹梁生產大隊。
1984年，全國實行政社分設，撤銷包樹梁生產大隊，設立包樹梁村村民委員會，簡稱包樹梁村村委會。
1993年，屬巴中市（縣級）漁溪鎮管轄。
1996年，屬九鎮鄉管轄。
2000年，屬巴中市巴州區九鎮鄉管轄。
2013年，屬巴中市恩陽區九鎮鄉管轄。
2019年，行政區劃調整，劃歸九鎮管轄。
2020年，村級建制調整，將石洞寺村、包樹梁村合并，設包樹梁村。