飛龍觀街市形成于清雍正年間,清康熙年間,境域屬洪合鄉上南路,清康熙二年(1663年),屬洪合鄉上南路。
清嘉慶年間,屬飛龍團。
清乾隆二十二年(1757)頒布保甲法,境域內為飛龍觀保和興隆場保。
清乾隆二十三年(1758年),屬飛龍觀保。
清嘉慶后,又改為團,分別為飛龍團和興隆團。
民國二十三年(1934),將飛龍團、興隆團、郅安團合并為飛龍鎮,次年隸屬第3區。
鎮鄉正式成為一級基層行政機關。
民國二十九年(1940年),改鄉公所。
1950年,行政區劃作重大調整,境域設有飛龍、興隆、安隆鄉,均屬12區管轄。
1955年12月,三鄉部分合并為飛龍鄉。
1958年政社合一,并調整區劃,興隆、安隆鄉分別劃給趙化公社和飛龍公社。
1961年,又分設興隆公社。
1981年,興隆公社更名新農公社。
1983年底,為新農鄉。
1984年,改公社為鄉,境域有飛龍鄉和新農鄉。
2001年4月,撤區并鄉建鎮,飛龍鄉與新農鄉合并建飛龍鎮,直屬富順縣。