清雍正八年（1730年），設九龍場。
光緒三十三年（1907年），場改鄉。
民國二十四年（1935年）7月，改九龍鎮。
民國三十一年（1942年）6月，鎮改鄉。
1953年4月，析置里仁、七星2鄉；同年9月，析置馬鹽、打鼓2鄉；同年11月，七星鄉更名石鼓鄉。
1956年1月，里仁、石鼓、馬鹽、打鼓4鄉并入九龍鄉。
1961年8月，析置石鼓、新合2鄉。
1967年7月，改為東升公社。
1973年1月，更名九龍公社。
1984年，公社改鄉。
1985年8月，鄉改鎮。
1994年1月，石鼓、新合2鄉并入九龍鎮。
2019年12月，撤銷風埡鄉，將其所屬行政區域劃歸九龍鎮管轄。