東漢初平四年（193）分充國縣置西、南二充國縣，兩縣境大體以寶馬河為分界線。
故推測現三官鎮轄區分別屬于西充國縣和南充國縣。
明嘉靖二十一年（1542）南部縣共轄9里，現三官鎮轄區屬于宣化可能性較大。
清道光二十九年（1849）已有三官場，清光緒三十二年（1906）現三官鎮轄區屬于宣化鄉。
清宣統二年（1910）屬于建興鄉。
民國24年（1935）置聯保處，屬于南部縣一區。
民國26年（1937）屬于增設的南部縣第五區。
民國29年（1940）置鄉。
民國30年（1941）屬于南部縣第三區。
民國31年（1942）屬于南部縣第五指導區。
民國36年（1947）已為三官鄉。
[20]1949年解放。
1950年建三官鄉，屬于南部縣第七區。
1958年成立三官公社，屬于建興區。
1966年改名前鋒公社，1971年恢復三官公社，1984年改回三官鄉，1991年屬于建興區，1992年并入建興鎮，1994年析出置三官鎮。
1996年屬于建興區。
2001年南部縣撤銷區委，區工委，建立督導辦。
2004年三官鎮屬于建興區。