從元代到明神宗萬歷十八年(1590)之前,兩河堡為土司領地,隸屬龍州宣撫司,清代歷朝(1644-1912)兩河堡隸屬龍安府直屬領地,民國初期,平武全縣置團練公所,兩河堡為兩河堡村公所,隸屬于龍安鎮公所,1935年4月11日至6月5日期間,紅軍建立蘇維埃政權,兩河堡設羊腸關蘇維埃和黃寶山蘇維埃,屬平武縣直屬蘇維埃,1936年6月后,平武推行“聯保”新政,兩河堡為第十三保,1940年實施新縣制,將聯保改組為鄉鎮,兩河堡隸屬龍安鎮,1950年1月(平武縣人民政府成立)至1958年,兩河堡村隸屬枕流鄉,1958年9月至1984年,兩河堡村改為兩河堡大隊,歸屬古城區枕流人民公社,1984年3月,全縣改公社為鄉、大隊為村、生產隊為村民小組,兩河堡村隸屬古城區枕流鄉,1992年8月28日,省委16號文件撤區并鄉建鎮,將枕流鄉所屬行政區劃歸龍安鎮管轄,至今兩河堡村連同所轄8個村民小組,隸屬平武縣龍安鎮。