民國初期，屬平羌鄉土主場、楊家河場。
民國二十四年（1935年），屬土主鎮，駐土主場。
民國二十九年（1940年），改土主鄉。
1951年，屬土主、紅場2鄉。
1955年，2鄉合并為土主鄉。
1958年，土主、健豐、全福3鄉合并為土主公社。
1961年，析土主鄉區域置土主公社。
1984年4月，公社改鄉。
1988年7月，鄉改鎮。
1992年9月，全福鄉并入。
1998年6月，全福鄉析出。
2019年12月13日，撤銷石龍鄉，將原石龍鄉紅月村和平和村所屬行政區域劃歸土主鎮管轄。