娜姑鎮位于云南省會澤縣西部，東距縣城23公里，東接金鐘鎮、五星鄉；南鄰大海鄉；西瀕小江和金沙江，與東川區及四川省會東縣隔水相望；北與老廠鄉和巧家縣蒙姑鄉接壤。地理位于北緯26o19＇～26o 35＇，東經103 o 03＇～103 o 14＇，鎮境內東西最大橫距17公里，南北縱距30公里。鎮政府駐地地理坐標為北緯26 o31＇東經l03 o09＇，海拔1920m。系滇、川兩省交界的烏蒙山區腹地。
娜姑鎮土地總面積264.9平方公里，其中：壩區25平方公里，占土地總面積的9.5 ％；山區239.9平方公里，占90.5 ％。西部邊緣為小江斷裂帶和著名的泥石流區。由于受小江、金沙江的強烈切割，河谷部分巖層垂直裂隙，形成深邃峽谷。整個地勢由東北向西南傾斜，呈階梯式下降，形成三級階地的小壩子：拖車壩子，海拔2180米，面積7千畝；娜姑壩子，海拔1920米，面積3萬畝；干海子壩子，海拔1620米，面積3千畝。境內最高海拔2896米(白龍潭粱子)，最低海拔695米(小河口)，全鎮相對高差220l米。
娜姑鎮境內群山綿亙，有大小山峰33座，屬烏蒙山脈，均為由西北東南走向。其中白龍潭梁子海拔2896米，大竹山海拔2865米，那紅山海拔2679米，薄刀嶺海拔2410米，蓮花山海拔2271米。
主要河流有小江、以禮河及海河，皆屬金沙江水系。小江發源于尋甸縣清水海，由南向北流入金沙江，全長148公里，下游流經娜姑鎮境內28公里，流域面積60.4平方公里，河床高差305米，平均坡度為10.9 ％。以禮河發源于待補鎮的野馬川，由南向北流經巧家縣匯入金沙江，全長122公里，流域面積2558平方公里，河床高差1400米，年均流量15.9立方米／秒。海河發源于娜姑壩子北部，向南流經隧洞后，轉向北流經王家山注入小江。全長28公里，年均流量1．24立方米／秒，流域面積191.7平方公里，河床高差為1220米，平均坡度40.3%，有效灌溉面積2121畝。
全鎮屬南溫帶高原季風氣候，其特點是：夏無酷署，冬無嚴寒，四季不分明，干濕分明，由于境內地形地貌復雜，海拔相對高差大，立體氣候十分明顯，各種自然災害頻繁。境內冬季由于受大陸季風氣候影響，氣候干冷，雨量少，晴天多，風干物燥，年平均氣溫13.1oC ，最熱月7月份月平均氣溫為19.4oC，最冷月1月份月平均氣溫5.1oC.。