清系世襲阿朵土千戶領有，沿襲十三年。
清康熙年間（1662~1722年），屬巧家伙目管轄。
清雍正年間（1723~1735年），為五甲。
民國初期，小河、六合、新店分為上、中、下五甲，小河為下五甲。
民國二十八年（1939年），改七區，轄1鎮、4鄉、33保、218甲。
民國二十九年（1940年）廢區，改稱小河鎮。
1950年3月，改小河區。
1952年，仍置五區，轄28個鄉。
1953年，轄22鄉。
1954年，先后將東坪區管轄的紅山、紙廠、保坪、黑鐵、安邦等鄉劃歸小河區。
1958年，改小河公社。
1961年，設下河區。
1962年，調整規模為小河區。
1963年，析置為小河、新店2區。
1969年，改稱小河公社。
1970年，改稱小河公社。
1984年，改小河區；紅山、保坪、黑鐵、紙廠、安邦4個鄉劃歸紅山區。
1988年，區改鄉，改小河鄉。
2002年8月，改小河鎮。
2006年，撤銷六合鄉，將六合、壩統、木廠、馬店、四村劃歸小河鎮。