蜀漢建興三年（225）諸葛亮平定南中設云南郡，隋開皇三年（583）廢郡止。
唐宋時期，設品甸、云南兩賧（州）。
元憲宗六年（1256）立品甸千戶所屬大理下萬戶府，至元十三年（1276）品甸千戶所改設云南州屬大理府；同時設十二關防送千戶所于米甸楚場，直屬大理府。
明洪武十五年（1382）改云南州為云南縣，隸大理府趙州（今鳳儀）；十七年（1384）筑洱海衛城（今祥城），設洱海衛，成化十二年（1476年）設瀾滄兵備道，直至清順治十七年（1660）裁瀾滄兵備道止。
明洪武十五年（1382）改元置十二關防送千戶所為十二關長官司仍直屬大理府；弘治二年（1489）設你甸（米甸）、楚場、安南坡（今下莊安南關）3巡檢司，直屬大理府，同時設云南驛土驛丞，至清康熙五年（1666）3個巡檢司及土驛丞同時裁除；清代云南縣屬大理府。
1918年，因省縣同名，云南縣改稱祥云縣，名稱沿用至今。
1947年，屬第八行政督察區。
1950年屬大理專區。
1960年屬大理白族自治州。