清雍正九年（1731年），屬大關清軍撫夷府。
清宣統二年（1910年），屬大關廳。
民國四年（1915年），置大關縣，屬大關。
民國六年（1917年），從大關縣分設鹽津縣后，屬鹽津縣。
1958年12月，隨縣并入大關縣。
1961年5月，鹽津、大關分治，屬鹽津。
1970年3月，改公社。
1984年4月，政、社分設，改稱區公所。
1987年10月，鹽井鎮被分為城關區公所和鹽井鎮2個部分。
1988年4月，城關區公所和鹽井鎮合并稱鹽井鎮。
2001年4月，建立鹽井鎮街道和黃桶槽新區2個居民委員會。
2002年12月，鹽沖、黃柵槽兩個居民委員會調整設立老街、水井街、文興街、黃桶槽4社區居民委員會。
2006年4月，撤鄉并鎮，艾田鄉的仁和村、椒子村并入鹽井鎮。