宋代大理國時期，因遠鎮境域為因遠部。
元朝、明朝時期，為因遠羅必甸長官司及奉化州駐地。
明朝時期，設因遠驛清置因遠巡檢，隸屬元江直隸州。
民國二年（1913年），因遠巡檢改分治員。
民國四年（1915年），分治員改縣佐。
民國十七年（1928年），廢因遠縣佐，設縣轄區。
民國二十八年（1939年），劃分為2個縣轄鎮，即因遠鎮、安定鎮。
1950年，設第三區轄因遠、浦貴、咪哩區。
1953年劃歸紅河縣的垤瑪公社火沒、三春、補崗一帶。
1958年，第三區為因遠、咪哩、都癸3公社。
1962年，又將都癸、因遠合并設第三區1970年，第三區改為因遠公社。
1982年，劃出5大隊（浦貴、都癸、路同、伴坤、哈浦）設浦貴公社。
因遠公社轄因遠、安定、車垤、卡臘、北澤5大隊。
1983年，恢復區。
1988年，撤區建因遠鎮。