明宣德五年（1430），析崇德東境募化、千金、保寧、清風、永新、梧桐六鄉置桐鄉縣，設縣治于梧桐鄉鳳鳴市（今梧桐街道）。
清，崇德、桐鄉兩縣同隸屬嘉興府。
康熙元年（1662），因崇德之名與清太宗皇太極年號同，故避諱稱石門縣，同時改石門鎮為玉溪鎮。
1912年，廢嘉興府，石門、桐鄉兩縣屬錢塘道。
1914年，石門復稱崇德。
1927年廢道制，兩縣直屬浙江省政府。
1938年劃屬浙江省第二行政督察區。
1939年至1947年屬浙江省第十行政督察區。
1948年后屬浙江省第一行政督察區。
1949年5月，桐鄉、崇德先后解放。
中華人民共和國成立后，崇德、桐鄉兩縣同隸屬嘉興專區。
1958年11月，崇德縣并入桐鄉縣。
1970年，改嘉興專區為嘉興地區，桐鄉縣隸屬嘉興地區。
1983年，撤銷嘉興地區，分設嘉興市、湖州市，桐鄉縣隸屬嘉興市。
1993年，桐鄉撤縣設市，隸屬嘉興市。