明、清時分屬青田縣八都、九都。
清宣統(tǒng)元年（1909）屬青田縣南田鄉(xiāng)、鰲里鄉(xiāng)。
1947年屬青田縣岙里鄉(xiāng)、三陽鄉(xiāng)。
1948年劃歸文成縣。
1949年屬南田區(qū)鰲里鄉(xiāng)、初陽鄉(xiāng)。
1950年屬南田區(qū)石西鄉(xiāng)、篁莊鄉(xiāng)。
1952年改屬西坑區(qū)石莊鄉(xiāng)、西里鄉(xiāng)、篁莊鄉(xiāng)。
1956年復屬南田區(qū)石西鄉(xiāng)、篁莊鄉(xiāng)。
1958年篁莊鄉(xiāng)并入石西鄉(xiāng)。
1961年設百丈漈公社。
1981年又改為石莊公社。
1984年改設石莊鄉(xiāng)。
1985年由石莊鄉(xiāng)析置篁莊鄉(xiāng)。
1992年石莊鄉(xiāng)、篁莊鄉(xiāng)、黃嶺鄉(xiāng)合并設百丈漈鎮(zhèn)。
2011年二源鄉(xiāng)及富岙鄉(xiāng)后村并入，2016年1月析置二源鎮(zhèn)，沿用至今。