毛藏鄉地處祁連山東部腹地，東鄰大紅溝鄉，西南與哈溪鎮和青海省門源縣接壤，北靠祁連和旦馬鄉，距縣城166公里，總土地面積為586.4平方公里，占全縣總土地面積的9.7%，其中牧草地占總土地面積的84.27%，是我縣純牧業鄉之一。
全鄉轄4個行政村，13個村民小組，共292戶，1343人，其中藏族占總人口的77.25%。年平均氣溫-0.2攝氏度，平均降水量為600－700毫米，全年無霜期60天，海拔2579－4874米。林地面積7438.72公頃。境內礦產資源豐富，現已探明的有煤、螢石、銅、鐵、鉛、鋅等。水資源充沛，森林茂密，生長和棲息著十多種野生中藥材和野生動物，被列為祁連山自然保護區。
2004年，毛藏鄉完成農牧業總產值323萬元，比上年增長了24.7%，年末大小畜存欄23621頭（只），其中大畜3610頭，小畜20011只，大小畜出欄10349頭（只），出欄率達43.8%，肉類總產量269噸，農牧民人均純收入為1763元，比上年增長了13%。
毛藏地區廣袤，礦產、生態、旅游等資源富集。特色牧業的發展已成為推動經濟快速增長、不斷優化升級的主流。草產業開始步入規模化建設軌道，品牌效應已經顯現，特種畜禽養殖勢頭趨好，發展特色畜牧業有得天獨厚的優勢。
毛藏民族莊院即察科囊建于清代晚期，位于毛藏河北岸700米處，毛藏寺西200米的山丘陽坡上。毛藏寺，藏語稱""霍爾秀恰貢""，意為""一對柏樹之寺""，簡稱""霍爾寺""。據傳此地是霍爾一位大成就者轉世居住的地方。寺院建于清初，同治年間被毀，民國24年（公元1935年）修復，有大經堂一座，囊謙兩處（擦科囊，祝千囊），其它佛殿數座，附近尚有洛把小寺和""奧些""靜修院，現已被毀。1982年5月8日重新開放，為縣級文物保護單位。
毛藏海拔高，水資源豐富、牧草旺盛、氣候寒冷且變化異常的獨特環境，培育形成了耐寒冷、適應性強的優良牦牛畜種，其中天祝白牦牛有200多頭，可作為天祝白牦牛小型培育基地。生產的畜產品主要有牛絨、牛奶、酥油等，質量上乘。
境內森林茂密，灌木叢林分布面廣，生長著冬春夏草、柴胡、秦艽、竹節羌活、大薊、藏紅花等十多種野生中藥材和鹿角菜、石花等天然野菜，目前雖未被開發利用，但蘊藏著巨大的潛力。.