后亭村原管轄后寨、北亭、大田，于1961年分別設立將后寨、北亭結合為后亭大隊，1965年成立陳氏祠堂、后亭村位于沙井公社的北游地位，自1970年后亭村主要以耕田、養魚為村的主要發展，當時有人口100余人，一個自然村、兩個村民小組，隨著解放，后亭大隊于1983年改為后亭村。
1993年1月，原深圳市寶安縣沙井鎮后亭村民委員會改為深圳市寶安區沙井街道后亭村民委員會。
2004年7月，因為城市化改制，更名為后亭社區居民委員會，隸屬沙井街道，名稱沿用至今。