北宋元豐年間（1078年—1085年），屬海陽縣延德鄉。
北宋宣和三年（1121年），從海陽縣析出12都建置揭陽縣，龍溪屬海陽縣。
南宋紹興二年（1132年），潮陽、揭陽并入海陽，龍溪都再屬海陽。
南宋紹興八年（1138年）恢復揭陽縣，龍溪屬之。
明嘉靖四十二年（1563年），龍溪都從揭陽割歸海陽縣。
清康熙三年（1664年），斥地，龍溪都被斥出界外。
清康熙（1669年），恢復龍溪都。
民國三年（1914年），海陽縣改稱潮安縣，龍溪都改稱龍溪區。
民國十九年（1930年），龍溪區改稱潮安縣第八區。
民國二十七年（1938年），撤區，第八區中的溪中鎮改為庵埠鎮。
民國三十四年（1945年），第八區恢復。
民國三十五年（1946年），原第八區分內龍鄉和外龍鄉。
1949年，內龍鄉和外龍鄉合并為龍溪區。
1950年3月，龍溪區改稱潮安縣第八區，同年7月，劃出集鎮內等地成立庵埠鎮，為區級鎮。
1953年，撤鎮歸區，仍在集鎮內設置鄉級鎮，仍稱庵埠鎮。
1955年5月，第八區改稱庵埠區。
1956年2月，原庵埠區地域分為郭隴、劉隴、仙溪、大鑒4鄉和庵埠鎮。
1956年12月，原庵埠區分為1鄉1鎮，即劉隴鄉和庵埠鎮。
1958年4月，并1鄉1鎮為庵埠鎮。
同年9月，庵埠鎮改稱庵埠公社。
1961年，庵埠公社一分為二，分出劉隴公社。
1962年，兩公社合并為庵埠公社。
1966年，從公社劃地置庵埠鎮。
1983年3月，撤銷潮安縣，庵埠公社屬潮州市。
同年12月，撤公社，置庵埠區和庵埠鎮。
1987年，撤區鎮，總稱庵埠鎮。
1992年，潮安縣恢復建制，庵埠鎮屬之。
2013年6月28日，撤銷潮安縣，設立潮安區，庵埠鎮改屬潮安區。